- RT/PCR-RFLP IBDV için çok popüler bir tanı
yöntemi haline gelmiştir:
- IBDV nin hızlı saptanması
- Bursal materyalden direkt saptama.
- Fenol ve kloroform solüsyonlarında saklanan
bursa örneklerinden IBDV’nin saptanması örneklerin
bütün dünyada kolayca nakledilmesisini sağlar.
- Test iki kısımdan oluşur:
- RT/PCR: VP2 geninin spesifik bir kısmını
büyütür(amplifikasyon).
- RFLP: büyütülen(amplifiye edilen) VP2 parçacığı
spesifik sınırlandırıcı enzimler tarafından
sindirilir. Geriye kalan sınırlandırılmış
parçalar jel elektroforez yöntemi ile incelenir.
Farklı parçacık yapılarına dayanarak IBD
virusleri identifiye edilir ve moleküler gruplara
ayrılır. Jackwood ve ark. (2001) 6 moleküler grup
tanımlamıştır. Bir gruplataki IBDV suşları soy bakımından
ilişkilidir. RFLP profilleri IBDV suşları arasındaki
nispi genetik farklılıkların saptanmasına
imkan verir, yine de virüsler arasındaki gerçek
antijenik farklılıkların saptanması için in
vivo testler kullanılmalıdır.
- Test VP2 geninin bir kısmındaki antijeniteden
sorumlu genetik diziyi saptar, bundan dolayı
benzer RFLP profiline sahip virusler potansiyel
olarak antijenetik olarak benzerdir.
- Benzer şekilde farklı RFLP profiline sahip
virüsler potansiyel olarak antijenetik olarak
farklıdır.
- Yine de RFLP modelleri tarafından belirlenen
bazı genetik değişiklikler VP’nin protein
dizilimini ve buna bağlı olarak antijenetik
özelliklerini etkileyemeyebilirler. Böylelikle
farklı RFLP profillerine sahip viruslerin
antijenetik olarak benzer olduğu olasılığı
ortaya çıkar.
- (not: RFLP sadece VP2’nin(HVR’nin sadece
%10-20 si olan birkaç enzim için sadece bazı
kesim kısımları) çok değişken (hypervariable
)kısımındaki (HVR) sınırlı sayıda baz çiftini
saptar. Filojenik ağaç için dizilimler gereklidir).
«Önceki
sayfa
PDerleyen Dr J J (Sjaak) de Wit ve
William Baxendale
|